北京城市生态系统研究站地处首都北京，依托中国科学院生态环境研究中心城市与区域生态国家重点实验室，它是中国城市系统研究网络（CERN）中首家以城市生态系统为研究对象的生态站点。从2001年启动建设至今，它融监测、研究和示范为一体，开展北京城市生态系统中水分、土壤、生物和大气等生态要素的长期定位监测和城市生态系统的格局和过程演变的研究，同时也联合北京市相关部门开展中小学生的科普和教育工作。

建站以来，北京城市站先后培养博士和硕士研究生数十名，发表科研论文300余篇，其中SCI论文百余篇。同时，它还广泛开展多种形式的国内外交流与合作，先后有美国、德国等多国城市生态方面的专家和学者来中心访问或讲学，生态站的主要管理和研究人员也分别到美国的城市站Baltimore和Phoenix考察。